Biologie Moléculaire
Offre de service
Comme pour tous les laboratoires dans le périmètre de la plateforme, le 3P met ici à disposition de ses utilisateurs des espaces de travail, des consommables et des équipements. De plus les référents des espaces accueillent et forment les nouveaux utilisateurs et apportent une assistance technique. Une expertise scientifique est apportée au besoin.
Composition de l'espace
L’espace Biologie Moléculaire est composé des pièces suivantes :
C-08 (salle extraction) : pièce où l’on manipule obligatoirement les CMR et les produits chimiques dangereux par inhalation sous sorbonne (notamment pour les extractions d’acides nucléiques).
C-09 (salle PCR-Mix) : pièce où l’on prépare les mix pour les PCR, hors ajout des échantillons. La pièce C-09 est une pièce ADN/ARN-free, il est strictement interdit d’y faire entrer des échantillons contenant de telles molécules (sauf amorces PCR).
C-11 (salle PCR) : Pièce où on ajoute les échantillons aux mix préparés en C09 et où on lance les cycles PCR dans les thermocycleurs.
C-13 (Laboratoire principal de Biologie Moléculaire) : Pièce où on effectue toutes les autres activités de biologie moléculaire (électrophorèse, extraction d’acides nucléiques avec kits commerciaux sans produits chimiques dangereux, quantification, etc.). A l’intérieur de cette pièce se trouvent en plus :
- La pièce BET : pièce où sont révélés les gels d’agarose avec du BET.
- La pièce Quantification d’Acides Nucléiques
Equipements
Les équipements mis à disposition dans l’espace scientifique partagé sont listés dans le tableau suivant [1]. Pour certains équipements une formation est obligatoire.
Equipement | Référents (suivi équipement et assistance technique) | Entretien et suivi[2] (si √: décrit dans fiches équipements) | Obligation de formation | Mode opératoire/Tutoriel disponible |
Agitateurs (basculants, magnétiques, magnétiques chauffant, orbitaux, etc.) | Référents Espace Biologie Moléculaire | |||
Armoire de stockage de produits chimiques dangereux | Référents Hottes | √ | ||
Bains-marie | Référents Espace Biologie Moléculaire | √ | ||
Balance | Référents Balances | √ | ||
Bio-dot | ||||
Centrifugeuses divers formats | Référents Centrifugeuses | √ | √ | |
Congélateurs et réfrigérateurs clients | ||||
Congélateurs et réfrigérateurs 3P | Référents Congélateurs et réfrigérateurs | √ | ||
Cuves électrophorèse (5x6 à 20x30cm) | Référents Espace Biologie Moléculaire | |||
Etuve 37°C | Référents étuves et incubateurs | √ | ||
Four à hybridation | ||||
Four à micro-ondes | Référents Espace Biologie Moléculaire | |||
Four UV | Référents Espace Biologie Moléculaire | √ | ||
Générateurs pour électrophorèse | Référents Espace Biologie Moléculaire | |||
Hottes PCR | Référents Espace Biologie Moléculaire | |||
Imprimante pour gels d’agarose | Référents Espace Biologie Moléculaire | |||
Lampe photo | Référents Espace Biologie Moléculaire | |||
Lampe UV | Référents Espace Biologie Moléculaire | |||
Machine à glace | Référents Espace Biologie Moléculaire | √ | ||
Micropipettes clients | ||||
Micropipettes 3P | Référents micropipettes | √ | ||
Plaque chauffante | Référents Espace Biologie Moléculaire | |||
Pompes à vide | ||||
Sorbonne | Référents Hottes | √ | ||
Speedvac | Référents Centrifugeuses | √ | √ | |
Storage Phospor System | ||||
Systèmes de quantification des acides nucléiques (Tapestation, Qubit, Nanodrop) | Référents Automates de biologie moléculaire | √ | √ | √ |
Transilluminateurs UV | Référents Espace Biologie Moléculaire | √ | ||
Thermocycleurs | Référents thermocycleurs | √ | ||
Ultrapurificateur d’eau MilliQ | Référents Espace Biologie Moléculaire | √ | √ | |
Vacuum blotters | Référents Espace Biologie Moléculaire | |||
Vortex (mono et 24 tubes) | Référents Espace Biologie Moléculaire | |||
GBox | Référents Espace Biologie Moléculaire | √ |
[1] Certains équipements peuvent être présents dans l’espace mais hors périmètre plateforme (italique). L'accès à ces équipements peut être envisagé et doit alors être discuté lors de la demande d'utilisation de la plateforme.
[2] L’entretien et suivi, le cas échéant, sont décrits dans des fiches équipements, disponibles auprès des référents de l’espace. Les consommables nécessaires à la maintenance des équipements assurée par la plateforme sont listés dans l’enregistrement « consommable et suivi de stock de l’espace Biologie Moléculaire»
Consommables et suivi de stocks
La plateforme met à disposition les consommables (inclus dans les frais d’accueil) listés dans les deux tableaux suivants qui indiquent la fréquence de vérification et le niveau de stock maintenu. En cas de rupture de stock d’un de ces consommables l’utilisateur doit en faire part aux référents via a minima l’ouverture d’une fiche de dysfonctionnement et d’action d’amélioration. Un besoin d’une quantité exceptionnelle d'un consommable devra faire l'objet d'une demande particulière des utilisateurs aux référents de l’Espace.
Consommables fournis par la plateforme et inclus dans les frais d’accueil
Consommables | Fréquence vérification du stock | Niveau de stock maintenu |
Agarose LE | Semestriel | 5 pots 1kg |
Anios Surfa’Safe | Hebdomadaire | 5 bouteilles |
Aniosafe savon doux | Hebdomadaire | 5 bouteilles |
Barrettes PCR | Hebdomadaire | 5 boites de 120 barrettes |
Bleu de charge | Semestriel | 1L 500 ML |
Embouts micropipettes à filtres | Hebdomadaire | 5 sacs de 1000 embouts |
Embouts micropipettes sans filtres | Hebdomadaire | 20 sachets de 250 ou 1000 embouts (selon référence) |
Films aluminium pour plaques PCR | Hebdomadaire | 10 boites de 100 films |
Gants nitrile | Hebdomadaire | 10 boites de chaque taille |
Marqueurs de taille | Suivi temps réel par fournisseur | Suivi par le fournisseur |
Microtubes Eppendorf 1.5 et 2mL | Hebdomadaire | 5 sacs de 500 |
Plaques PCR 96 puits | Hebdomadaire | 4 boites de 50 plaques |
Réservoirs à réactifs 55mL | Hebdomadaire | 10 réservoirs |
RNAse away | Hebdomadaire | 2 bidons 4L |
Sopalin | Hebdomadaire | 12 rouleaux |
TAE 50X* | Hebdomadaire | 1 bouteille de 1L |
Tubes Falcon (14, 15 et 50mL) | Hebdomadaire | 4 à 10 sachets de 20 à 50 tubes (selon référence) |
Consommables à la charge des utilisateurs
La plateforme n’assure aucun stock des consommables suivants, l’utilisateur assure lui-même la commande et la gestion de ces consommables. Il peut se rapprocher des responsables de commande pour la plateforme indiqués dans le tableau suivant.
Agaroses spécifiques (autre que LE) |
Amorces PCR |
Kits pour purification/extraction d’acides nucléiques, amplification PCR ou clonage |
Enzymes de restriction |
Produits chimiques fournis par la plateforme:
Produit | numéro CAS |
Agarose LE Seakem | n |
Charbon actif | 7440-44-0 |
Ethanol absolu | 64-17-5 |
Ethanol absolu 70° (en solution) et absolue | 64-17-5 |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | 6381-92-6 |
ethidium bromide | 1239-45-8 |
Polyoxyethylene Sorbitan monolaurate (TWEEN 20) | 9005-64-5 |
Proteinase K | 39450-01-6et 1185-53-1et 10035-04-8 |
Sodium dodecyl sulfate =Lauryl sulfate sodium salt | 151-21-3 |
TRIZMA Base | 77-86-1 |
Ethanol absolu | 64-17-5 |
Acetic Acid 99% | 64-19-7 |