Biologie Moléculaire

Offre de service

Comme pour tous les laboratoires dans le périmètre de la plateforme, le 3P met ici à disposition de ses utilisateurs des espaces de travail, des consommables et des équipements. De plus les référents des espaces accueillent et forment les nouveaux utilisateurs et apportent une assistance technique. Une expertise scientifique est apportée au besoin.

Composition de l'espace

L’espace Biologie Moléculaire est composé des pièces suivantes :
 C-08 (salle extraction) : pièce où l’on manipule obligatoirement les CMR et les produits chimiques dangereux par inhalation sous sorbonne (notamment pour les extractions d’acides nucléiques).
 C-09 (salle PCR-Mix) : pièce où l’on prépare les mix pour les PCR, hors ajout des échantillons. La pièce C-09 est une pièce ADN/ARN-free, il est strictement interdit d’y faire entrer des échantillons contenant de telles molécules (sauf amorces PCR). 
 C-11 (salle PCR) : Pièce où on ajoute les échantillons aux mix préparés en C09 et où on lance les cycles PCR dans les thermocycleurs.
 C-13 (Laboratoire principal de Biologie Moléculaire) : Pièce où on effectue toutes les autres activités de biologie moléculaire (électrophorèse, extraction d’acides nucléiques avec kits commerciaux sans produits chimiques dangereux, quantification, etc.). A l’intérieur de cette pièce se trouvent en plus :
 - La pièce BET : pièce où sont révélés les gels d’agarose avec du BET.
 - La pièce Quantification d’Acides Nucléiques

Equipements

    Les équipements mis à disposition dans l’espace scientifique partagé sont listés dans le tableau suivant [1]. Pour certains équipements une formation est obligatoire.

Equipement

Référents

(suivi équipement et assistance technique)

Entretien et suivi[2]

(si √: décrit dans fiches équipements)

Obligation de formation Mode opératoire/Tutoriel disponible
Agitateurs (basculants, magnétiques, magnétiques chauffant, orbitaux, etc.) Référents Espace Biologie Moléculaire      
Armoire de stockage de produits chimiques dangereux Référents Hottes    
Bains-marie Référents Espace Biologie Moléculaire    
Balance Référents Balances    
Bio-dot        
Centrifugeuses divers formats Référents Centrifugeuses  
Congélateurs et réfrigérateurs clients        
Congélateurs et réfrigérateurs 3P Référents Congélateurs et réfrigérateurs    
Cuves électrophorèse (5x6 à 20x30cm) Référents Espace Biologie Moléculaire      
Etuve 37°C Référents étuves et incubateurs    
Four à hybridation        
Four à micro-ondes Référents Espace Biologie Moléculaire      
Four UV Référents Espace Biologie Moléculaire    
Générateurs pour électrophorèse Référents Espace Biologie Moléculaire      
Hottes PCR Référents Espace Biologie Moléculaire      
Imprimante pour gels d’agarose Référents Espace Biologie Moléculaire      
Lampe photo Référents Espace Biologie Moléculaire      
Lampe UV Référents Espace Biologie Moléculaire      
Machine à glace Référents Espace Biologie Moléculaire    
Micropipettes clients        
Micropipettes 3P Référents micropipettes    
Plaque chauffante Référents Espace Biologie Moléculaire      
Pompes à vide        
Sorbonne Référents Hottes    
Speedvac Référents Centrifugeuses  
Storage Phospor System        
Systèmes de quantification des acides nucléiques (Tapestation, Qubit, Nanodrop) Référents Automates de biologie moléculaire
Transilluminateurs UV Référents Espace Biologie Moléculaire    
Thermocycleurs Référents thermocycleurs    
Ultrapurificateur d’eau MilliQ Référents Espace Biologie Moléculaire  
Vacuum blotters Référents Espace Biologie Moléculaire      
Vortex (mono et 24 tubes) Référents Espace Biologie Moléculaire      
GBox Référents Espace Biologie Moléculaire    

[1] Certains équipements peuvent être présents dans l’espace mais hors périmètre plateforme (italique). L'accès à ces équipements peut être envisagé et doit alors être discuté lors de la demande d'utilisation de la plateforme.

[2] L’entretien et suivi, le cas échéant, sont décrits dans des fiches équipements, disponibles auprès des référents de l’espace. Les consommables nécessaires à la maintenance des équipements assurée par la plateforme sont listés dans l’enregistrement « consommable et suivi de stock de l’espace Biologie Moléculaire»

Consommables et suivi de stocks

La plateforme met à disposition les consommables (inclus dans les frais d’accueil) listés dans les deux tableaux suivants qui indiquent la fréquence de vérification et le niveau de stock maintenu. En cas de rupture de stock d’un de ces consommables l’utilisateur doit en faire part aux référents via a minima l’ouverture d’une fiche de dysfonctionnement et d’action d’amélioration. Un besoin d’une quantité exceptionnelle d'un consommable devra faire l'objet d'une demande particulière des utilisateurs aux référents de l’Espace.

Consommables fournis par la plateforme et inclus dans les frais d’accueil

Consommables Fréquence vérification du stock Niveau de stock maintenu
Agarose LE Semestriel 5 pots 1kg
Anios Surfa’Safe Hebdomadaire 5 bouteilles
Aniosafe savon doux Hebdomadaire 5 bouteilles
Barrettes PCR Hebdomadaire 5 boites de 120 barrettes
Bleu de charge Semestriel 1L 500 ML
Embouts micropipettes à filtres Hebdomadaire 5 sacs de 1000 embouts
Embouts micropipettes sans filtres Hebdomadaire 20 sachets de 250 ou 1000 embouts (selon référence)
Films aluminium pour plaques PCR Hebdomadaire 10 boites de 100 films
Gants nitrile Hebdomadaire 10 boites de chaque taille
Marqueurs de taille Suivi temps réel par fournisseur Suivi par le fournisseur
Microtubes Eppendorf 1.5 et 2mL Hebdomadaire 5 sacs de 500
Plaques PCR 96 puits Hebdomadaire 4 boites de 50 plaques
Réservoirs à réactifs 55mL Hebdomadaire 10 réservoirs
RNAse away Hebdomadaire 2 bidons 4L
Sopalin Hebdomadaire 12 rouleaux
TAE 50X* Hebdomadaire 1 bouteille de 1L 
Tubes Falcon (14, 15 et 50mL) Hebdomadaire 4 à 10 sachets de 20 à 50 tubes (selon référence)

Consommables à la charge des utilisateurs

La plateforme n’assure aucun stock des consommables suivants, l’utilisateur assure lui-même la commande et la gestion de ces consommables. Il peut se rapprocher des responsables de commande pour la plateforme indiqués dans le tableau suivant.

Agaroses spécifiques (autre que LE)
Amorces PCR
Kits pour purification/extraction d’acides nucléiques, amplification PCR ou clonage
Enzymes de restriction

Produits chimiques fournis par la plateforme:

Produit numéro CAS
Agarose LE Seakem n
Charbon actif 7440-44-0
Ethanol absolu 64-17-5
Ethanol absolu 70° (en solution) et absolue 64-17-5
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) 6381-92-6
ethidium bromide 1239-45-8
Polyoxyethylene Sorbitan monolaurate (TWEEN 20) 9005-64-5
Proteinase K 39450-01-6et 1185-53-1et 10035-04-8
Sodium dodecyl sulfate =Lauryl sulfate sodium salt 151-21-3
TRIZMA Base 77-86-1
Ethanol absolu 64-17-5
Acetic Acid 99% 64-19-7